李文飞
 

理学博士,教授
地址:南京市汉口路22号南京大学物理学院
电话:(+86)25-83594476
Email: wfli(at)nju.edu.cn
 

教育和工作经历:

2012.12 ---

南京大学物理学院,教授

2006.12 --- 2012.12

南京大学物理学院,副教授

2008. 5 --- 2010. 4

日本京都大学生物物理系,访问学者(合作导师:Shoji Takada教授)

2006. 9 --- 2006.11

南京大学物理系,讲师

2004. 9 --- 2006. 8

南京大学物理系,博士后

2004. 7 --- 2004. 8

德国Justus-Liebig University, Giessen, 访问学者

1999. 9 --- 2004. 6

中国科学院近代物理研究所、获理学博士学位

 

导师:徐瑚珊教授,张丰收教授,李君清教授

 

专业:粒子物理与原子核物理

 

论文:基于重离子输运理论对超重核合成及非对称核物质状态方程的研究

1995. 9 ---- 1999.7

内蒙古民族大学物理系,获学士学位(物理)

 
 
研究兴趣:
理论与计算生物物理:
1)
多尺度理论和计算方法,及其在生物大分子结构和动力学研究中的应用。
2)
辅助因子(包括金属离子、ATP, 及其它小分子)耦合的蛋白质结构和功能运动的理论和计算机模拟研究。
3)
涨落驱动的生物大分子机器大尺度功能运动。


教学:
 
承担南京大学本科生“计算物理学”教学工作。
 
招聘信息:
 
目前有博士后或专职副研究员职位空缺,年薪20万元以上,主要开展蛋白质分子机器功能动力学
的理论和计算机模拟研究,欢迎有志生物物理研究的博士毕业生应聘。简历投送至:wfli(at)nju.edu.cn
  
Publication list(2007 --)

 

1. Wenfei Li, Jun Wang, Jian Zhang, Wei Wang
  Molecular Simulations of Metal Coupled Protein Folding
  Current Opinion in Structural Biology 2015, 30:25-31

 

2. Wenfei Li, Wei Wang, and Shoji Takada
  Energy landscape views for interplays among folding, binding, and allostery of calmodulin domains
  Proc. Natl. Acad. Sci USA 2014, 111:10550-10555

 

3. Wenfei Li, Tsuyoshi Terakawa, Wei Wang, and Shoji Takada
  Energy landscape and multiroute folding of topologically complex proteins adenylate kinase and 2ouf-knot
  Proc. Natl. Acad. Sci USA 2012, 109:17789-17794

 

4. Wenfei Li, Peter G. Wolynes, and Shoji Takada,
  Frustration, specific sequence dependence, and nonlinearity in large-amplitude fluctuations of allosteric proteins,
  Proc. Natl. Acad. Sci USA 2011, 108: 3504-3509 

5. Wenfei Li and Shoji Takada,
  Characterizing protein energy landscape by the self-learning multiscale simulations: Application to a designed beta-hairpin,
  Biophys. J. 2010, 99: 3029-3037.  

6. Wenfei Li, Hiroaki Yoshii, Naoto Hori, Tomoshi Kameda, and Shoji Takada ,
  Multiscale methods for protein folding simulations,
  Methods 2010, 52: 106-114.  

7. Wenfei Li and Shoji Takada,
  Self-learning multiscale simulation for achieving high accuracy and high efficiency simultaneously,
  J. Chem. Phys. 2009, 130: 214108. 

8. Wenfei Li, Jian Zhang, Jun Wang and Wei Wang,
  Metal Coupled folding of Cys2His2 Zinc-finger,
  J. Am. Chem. Soc. 2008, 130: 892-900 

9. Wenfei Li, Jian Zhang, Yu Su, Jun Wang, Meng Qin, and Wei Wang,
  Effects of Zinc Binding on the Conformational Distribution of the Amyloid-b Peptide Based on Molecular Dynamics Simulations,
  J. Phys. Chem. B. 2007, 111: 13814-13821. 

10. Wenfei Li, Jiang Zhang, and Wei Wang
  Understanding the Folding and Stability of a Zinc Finger Based Full Sequence Design Protein with Replica Exchange Molecular Dynamics Simulations
  Proteins 2007, 67: 338-349.

 

11. Wenfei Li, Meng Qin, Zuoxiu Tie, and Wei Wang,

  Effects of solvents on the intrinsic propensity of peptide backbone conformations

  Phys.Rev.E 2011, 84: 041933

 

12. Wenhui Xi, Wenfei Li, and Wei Wang
  Template induced conformational change of amyloid-
β monomer
  J. Phys. Chem. B, 2012, 116: 7398
7405


 

 

 

 


 

 

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